其實，電子商務系統就是商務與技術貫穿的產物，因此在電子商務運用的全流程里，都一定要很好統籌這商務與技術兩個方面的要素，并且以科學、合理的程序展開系統設計、建設及應用工作。若是依照階段劃分，要完成電子商務運用，電商系統開發設立大概要歷經如下四大階段：

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一、商務解析階段

也是去完成電子商務應用計劃的第一步。該階段的工作主要是去做充分的商務分析，關鍵包含需求解析(涵蓋企業自身所需、市場所需和客戶所需等)及市場解析(涵蓋市場環境、客戶解析、供求解析與競爭解析等)兩個方面。

并且在電商系統開發條件下，市場范圍增大，創新速度增快，導致競爭的壓力也更大了，競爭的頻率也是越來越大，所以一定要對擬建的電子商務系統在未來會遭遇到的競爭盡可能做出解析，并最大限度地防止競爭失利。

另外，也是要對企業自身狀況做解析，包含對企業組織、管理、業務流程、資源、未來發展的解析等。要融合電子商務的特征，從供應鏈的角度重新審視企業組織、管理與業務流程，找尋和電子商務的最好結合部。

二、規劃設計階段

在達成以上商務解析的基礎上，在了解電子商務最新技術進展的狀況下，充分聯合商務和技術兩方面因素，提出電商系統開發的總體規劃，提出電子商務系統的系統角色，提出電子商務系統的總體格局，并明確電子商務系統的商務模式，以及和商務模式密切有關的網上品牌、網上商品、服務支持與營銷技巧四個要素。

電商系統開發設計工作能夠由此開展，也就是從子系統、前臺、后臺、技術支持、系統流程、人員設置等各個方面全面構架電子商務系統。該階段的工作達成的好壞，會直接關系到后續電子商務系統建設和將來電子商務系統運行及應用的能不能成功。

三、建設改變階段

該階段的工作分為兩條線：一條線是根據電子商務系統設計，全面整改、變革傳統的組織、管理與業務流程，以適應電子商務運作方式的需求;另一條線是遵照電子商務系統設計，全面做計算機軟硬件配置、網絡平臺建設及電子商務系統集成，實現電子商務系統技術支持體系的創建，從技術上保證電子商務系統的正常運作。

四、組合運行階段

如下創建變革階段達成后，就能夠把經過轉變的組織、管理及業務流程，和已經創建的電子商務技術平臺組合起來，進行電子商務系統的試運行。再歷經必要的整改、改進以后，完成電子商務應用的工作就能步入整合運行階段，開始完成電子商務運用。